Linux和Windows操作系统各自采用不同的文件系统，这些系统在结构、性能和兼容性等方面存在显著差异。这些差异不仅影响了操作系统的整体性能，还直接关系到用户在存储、访问和管理文件时的体验。Linux常用的文件系统如EXT4、XFS，具有高效的日志功能和文件权限管理，常用于服务器和高负载环境。相比之下，Windows主要使用NTFS文件系统，在用户友好性和兼容性上有所优势，但在某些情况下性能可能不及Linux的文件系统。
文件系统的结构差异是性能表现的关键因素。Linux的文件系统通常采用的块存储方式，使得对大文件的读取和写入速度更快。而Windows的NTFS虽然支持更多的特性，如压缩和加密，但在处理大量小文件时，性能却可能受到影响。Linux系统的分区管理更为灵活，用户可以根据需求自由配置，这在大规模数据处理和数据库管理时具有明显优势。
文件权限与安全性是两者的重要区别。Linux系统借助严格的权限控制机制，允许用户对文件的读取、写入和执行权限进行细致管理，提升了系统的安全性。而Windows也在NTFS中引入了访问控制列表（ACL），但相比Linux，很多用户并未充分利用这些权限设置，可能导致安全隐患。
兼容性问题常常成为用户选择操作系统的障碍。Windows因其广泛的应用支持，成为了大多数用户的首选，无论是在办公软件还是各类游戏中，兼容性表现优异。而Linux虽然在开发和服务器领域占据重要地位，但在桌面使用上，某些软件和硬件的支持程度显著不足，这可能会影响到用户的选择。
Linux与Windows的文件系统在性能和兼容性上各有优劣，选择合适的文件系统和操作系统，需根据特定使用场景和需求而定。无论是服务器管理还是个人桌面应用，了解各自的特点和优势才能更好地提升工作效率和使用体验。